Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PRCDQ00LT1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms