Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HERV-K104P61576 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms