Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK11-1P61568 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ERVK11-1P61568 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVK11-1P61568 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms