Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CABP4P57796 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CABP4P57796 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CABP4P57796 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CABP4P57796 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CABP4P57796 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms