Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TAF6P49848 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF6P49848 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF6P49848 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF6P49848 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF6P49848 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF6P49848 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF6P49848 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF6P49848 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF6P49848 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF6P49848 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF6P49848 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF6P49848 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF6P49848 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF6P49848 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF6P49848 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TAF6P49848 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TAF6P49848 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TAF6P49848 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TAF6P49848 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms