Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCLMP48507 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCLMP48507 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
GCLMP48507 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GCLMP48507 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GCLMP48507 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GCLMP48507 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GCLMP48507 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms