Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTR1BP42025 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms