Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 NSRP1-205ENST00000479218 540 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 FAM221A-201ENST00000344962 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC008443.6-204ENST00000511517 738 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC105202.1-203ENST00000518024 875 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC015878.2-201ENST00000584331 361 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 CCNG2-205ENST00000509972 1549 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 INSL6-201ENST00000381641 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 TMX3-202ENST00000443099 913 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 LINC01591-202ENST00000522279 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 CDH13-207ENST00000565636 810 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXD11P31277 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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