Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CLIP1P30622 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms