Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PEX2P28328 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PEX2P28328 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PEX2P28328 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms