Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHMLP26374 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMLP26374 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMLP26374 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHMLP26374 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHMLP26374 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMLP26374 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMLP26374 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMLP26374 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMLP26374 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMLP26374 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMLP26374 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMLP26374 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMLP26374 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMLP26374 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMLP26374 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMLP26374 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMLP26374 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHMLP26374 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMLP26374 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMLP26374 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMLP26374 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMLP26374 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMLP26374 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMLP26374 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMLP26374 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMLP26374 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMLP26374 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMLP26374 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHMLP26374 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms