Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTAFRP25105 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms