Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS6KB1P23443 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms