Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMNB1P20700 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms