Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AMY2BP19961 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms