Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB6P18564 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms