Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCL3L1P16619 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCL3L1P16619 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms