Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MUC1P15941 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MUC1P15941 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MUC1P15941 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
MUC1P15941 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MUC1P15941 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MUC1P15941 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MUC1P15941 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MUC1P15941 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MUC1P15941 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MUC1P15941 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MUC1P15941 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MUC1P15941 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MUC1P15941 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MUC1P15941 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms