Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNRPBP14678 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SNRPBP14678 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms