Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRF1P14222 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRF1P14222 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRF1P14222 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRF1P14222 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRF1P14222 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRF1P14222 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PRF1P14222 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRF1P14222 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRF1P14222 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRF1P14222 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRF1P14222 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRF1P14222 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRF1P14222 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRF1P14222 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms