Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PKHD1P08F94 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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