Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SFT2D2O95562 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SFT2D2O95562 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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