Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UFL1O94874 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UFL1O94874 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UFL1O94874 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UFL1O94874 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UFL1O94874 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UFL1O94874 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UFL1O94874 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UFL1O94874 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFL1O94874 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFL1O94874 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFL1O94874 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFL1O94874 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFL1O94874 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFL1O94874 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UFL1O94874 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFL1O94874 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFL1O94874 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFL1O94874 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFL1O94874 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFL1O94874 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFL1O94874 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UFL1O94874 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
UFL1O94874 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFL1O94874 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFL1O94874 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFL1O94874 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFL1O94874 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFL1O94874 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFL1O94874 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFL1O94874 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFL1O94874 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UFL1O94874 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms