Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAB2O43741 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms