Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DENRO43583 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DENRO43583 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DENRO43583 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DENRO43583 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms