Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSH5O43196 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MSH5O43196 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSH5O43196 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSH5O43196 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MSH5O43196 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSH5O43196 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSH5O43196 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSH5O43196 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSH5O43196 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSH5O43196 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSH5O43196 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSH5O43196 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MSH5O43196 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSH5O43196 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSH5O43196 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSH5O43196 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSH5O43196 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MSH5O43196 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
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