Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A2O14975 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms