Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFKBIEO00221 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms