Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LINC00587B1AMM8 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms