Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DBX1A6NMT0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms