Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCP1A6NGW2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms