Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMEM89A2RUT3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms