Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
E2F8A0AVK6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms