Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNR2-201ENST00000374472 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 L3MBTL4-203ENST00000400105 3546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNM1L-207ENST00000452533 4439 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSMD1-202ENST00000400186 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSMD1-217ENST00000602723 10938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYFIP2-201ENST00000435847 3673 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 HRH1-201ENST00000397056 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC37BP1-203ENST00000417404 4742 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHFR2-202ENST00000394221 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 LTBP1-202ENST00000404525 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDIK1L-202ENST00000374271 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHA4-203ENST00000409938 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH9-202ENST00000377865 5709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF569-202ENST00000392149 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLG2-229ENST00000531015 2892 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02367-201ENST00000567749 4388 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRB3-202ENST00000370598 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 GBP4-201ENST00000355754 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMBT1-202ENST00000338354 7686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMBT1-204ENST00000368909 7686 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHA3-201ENST00000234453 13880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSEN1-205ENST00000406768 4062 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 UNC79-205ENST00000555664 8484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEP1B-201ENST00000269202 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR75-201ENST00000314761 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRIA4-206ENST00000525187 2822 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDC42SE1-201ENST00000357235 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC109361.1-201ENST00000513220 3526 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091544.5-201ENST00000620192 3815 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 EGFLAM-201ENST00000322350 4411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
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