Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CADM3-AS1-201ENST00000415675 5044 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP1A3-201ENST00000302102 3597 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIP5K1-201ENST00000334933 5586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GNG12-201ENST00000370982 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 HPCAL4-202ENST00000612703 4436 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AP3B2-202ENST00000535348 3254 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM193A-204ENST00000505311 4110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MRS2-201ENST00000274747 3821 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ELOB-203ENST00000409906 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL133553.1-201ENST00000428391 353 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CPSF4-206ENST00000441580 942 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SNHG14-204ENST00000441592 608 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 COTL1P2-201ENST00000455360 352 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MT1DP-201ENST00000463480 191 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL806P-201ENST00000467399 282 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL7P-201ENST00000467823 298 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL571P-201ENST00000468302 295 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001024.1-201ENST00000474540 345 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL535P-201ENST00000479087 296 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GAPDHP35-201ENST00000513369 976 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL020996.2-202ENST00000527604 334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL132639.1-201ENST00000553698 475 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT18P18-201ENST00000565278 1279 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ENPP7P13-201ENST00000567922 259 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL498P-201ENST00000583650 298 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SNHG15-208ENST00000584327 505 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008569.1-201ENST00000590626 252 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PET100-205ENST00000601406 332 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006262.4-201ENST00000613498 286 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC116165.3-201ENST00000614524 400 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC135048.3-201ENST00000614997 328 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL17-202ENST00000616880 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068338.3-201ENST00000617892 418 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 UMPS-211ENST00000628619 228 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106774.8-201ENST00000639081 597 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MAMLD1-205ENST00000432680 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 QARS-209ENST00000464962 2362 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SCMH1-203ENST00000361191 2906 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ALS2CL-203ENST00000415953 3471 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAH10-209ENST00000614082 3484 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM55-204ENST00000353317 2624 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NTRK3-208ENST00000557856 2622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TCHP-201ENST00000312777 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DEF8-201ENST00000268676 3725 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RECQL5-201ENST00000317905 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 COL4A6-201ENST00000334504 6700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NUTM2B-202ENST00000372321 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RASSF5-209ENST00000636182 3427 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZIK1-207ENST00000599456 2860 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DAPK2-213ENST00000612884 8086 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CTAGE5-206ENST00000396158 3695 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO1C-204ENST00000545534 3676 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ACIN1-223ENST00000605057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MTA2-202ENST00000524902 2577 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RSU1-203ENST00000377921 3919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM196A-202ENST00000522781 4403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT6-203ENST00000354416 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FN1-205ENST00000357867 7898 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 VPS4A-201ENST00000254950 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 IRAK4-201ENST00000431837 4147 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EBF3-202ENST00000368648 4375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFYVE27-206ENST00000393677 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CDHR2-201ENST00000261944 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154 ms