Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 SYNJ1-203ENST00000382499 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PPP2R2C-202ENST00000335585 4092 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ANKRD13C-202ENST00000370944 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ARHGEF9-225ENST00000636276 4097 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ABCC5-201ENST00000265586 5712 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 LIMCH1-202ENST00000381753 5705 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 STAG3-218ENST00000615138 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TAF2-201ENST00000378164 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 AL645922.1-202ENST00000477310 3377 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 BLOC1S6-201ENST00000220531 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 AL031283.1-201ENST00000427824 5178 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 LRP2-202ENST00000443831 4007 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PRDM10-201ENST00000304538 5817 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 GALNT15-201ENST00000339732 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 MCCC2-201ENST00000340941 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF556-201ENST00000307635 6574 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PCDHGB6-202ENST00000616430 4601 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TECPR2-201ENST00000359520 8686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SH3D19-204ENST00000427414 2656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 RASGRF2-201ENST00000265080 8167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP12A-202ENST00000381946 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 LIPC-203ENST00000414170 2968 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SPIB-205ENST00000595883 3791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 IKZF5-201ENST00000368886 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SEMA4A-201ENST00000355014 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PRRG3-201ENST00000370353 5977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 RNF138-202ENST00000261593 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ADGRG2-204ENST00000357544 4678 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 COPA-202ENST00000368069 4664 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 MYT1-203ENST00000536311 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 UHRF1-207ENST00000624301 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 HSBP1-201ENST00000433866 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF888-202ENST00000638862 4195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 BCOR-201ENST00000342274 6390 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 AMMECR1-202ENST00000372057 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 DSC3-202ENST00000434452 6978 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF418-202ENST00000425570 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 AC118344.2-201ENST00000622968 4765 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 P2RX6-202ENST00000413302 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 RASAL1-204ENST00000546530 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 EDRF1-202ENST00000356792 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 LRRC37A3-201ENST00000319651 5537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 CNTN2-212ENST00000638378 4447 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SEZ6L2-202ENST00000346932 3015 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 EXOC7-201ENST00000332065 4596 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 PTK2B-203ENST00000397501 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 TEX2-204ENST00000583097 4852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 TEX2-210ENST00000615733 4852 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 PLXNA4-204ENST00000423507 3314 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 NCEH1-206ENST00000543711 4062 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 LHX9-203ENST00000367390 7413 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ADCY5-201ENST00000309879 2841 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SART3-202ENST00000431469 2834 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 THG1L-201ENST00000231198 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 OPALIN-202ENST00000393870 3578 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 OPALIN-204ENST00000419479 3581 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 L1CAM-201ENST00000361699 3888 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 STAG3-201ENST00000317296 4198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 RTN3-206ENST00000377819 4937 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ERCC3-201ENST00000285398 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 PCDHGC3-201ENST00000308177 4725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 SYTL2-201ENST00000316356 4293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 HIST1H2BI-201ENST00000377733 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 ALOXE3-202ENST00000380149 3362 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-2Q9BYR5 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.5 ms