Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 MIR4685-201ENST00000578185 69 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AC104073.4-201ENST00000632111 598 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 ADGRF2-204ENST00000507065 3043 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 ZNF667-208ENST00000629654 3265 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 TP53BP1-202ENST00000382039 6015 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 ZNF214-201ENST00000278314 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 SP110-203ENST00000358662 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 GDNF-202ENST00000344622 3655 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 TMEM269-204ENST00000637012 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AC113608.1-201ENST00000398740 305 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AC022296.2-201ENST00000512424 202 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 HKR1-223ENST00000591471 3472 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 FIGNL1-213ENST00000615084 3368 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 IFIT2-202ENST00000611722 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 MAP3K13-201ENST00000265026 9876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AMPD1-201ENST00000369538 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 LINC00261-202ENST00000564492 4912 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 FGF9-201ENST00000382353 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 MCF2L2-203ENST00000447025 2394 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 RN7SL647P-201ENST00000485429 300 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 LINC01748-202ENST00000634281 2864 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 TRIM6-201ENST00000278302 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 SNORA30B-201ENST00000365319 129 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
CACNB1Q02641 RPL34P22-201ENST00000468193 318 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms