Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 PAK5-203ENST00000378429 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CSTF2T-201ENST00000331173 4105 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNH7-202ENST00000332142 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TIAF1-201ENST00000359450 5337 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GP2-201ENST00000302555 3406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SZRD1-210ENST00000492354 3401 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SGSM2-211ENST00000574563 3410 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 C4orf50-201ENST00000324058 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MFN1-205ENST00000471841 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AMMECR1-202ENST00000372057 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ANGEL1-201ENST00000251089 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CEACAM6-201ENST00000199764 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BICD1-201ENST00000281474 3281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SRGAP2-215ENST00000605610 3212 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC42SE2-208ENST00000505065 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BEND3-202ENST00000429433 6654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KANSL1-211ENST00000575318 4935 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PEX5-202ENST00000266564 3170 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ATN1-202ENST00000396684 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NHSL2-202ENST00000510661 3082 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KBTBD4-209ENST00000533290 3079 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM19A2-201ENST00000416284 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ASAP3-201ENST00000336689 4050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GABBR1-201ENST00000355973 3506 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DDAH1-202ENST00000426972 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BARD1-213ENST00000619009 3967 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRC3-201ENST00000324659 3414 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MCF2L-202ENST00000375597 3413 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EDNRB-202ENST00000377211 4471 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MLC1-201ENST00000311597 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ADGRG1-266ENST00000568908 3852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SP1-201ENST00000327443 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PPY-201ENST00000225992 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CCL21-202ENST00000378792 599 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LY6G6E-225ENST00000383418 383 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV3-19-201ENST00000390309 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP41-201ENST00000411020 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TRGVA-201ENST00000413819 285 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018638.1-201ENST00000414464 330 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PGAM1P6-201ENST00000425684 747 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DEFA10P-201ENST00000455014 288 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL795P-201ENST00000469617 282 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 STXBP5L-204ENST00000471454 3813 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104212.1-201ENST00000472088 613 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL461P-201ENST00000484915 282 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL384P-201ENST00000490382 298 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL679P-201ENST00000497096 304 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GUSBP8-201ENST00000502652 679 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRPCP13-201ENST00000505417 190 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC060765.1-202ENST00000518367 257 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV3-31-201ENST00000523713 297 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002957.1-201ENST00000525952 406 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GANAB-216ENST00000540933 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355922.3-201ENST00000556341 578 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104316.2-201ENST00000559049 326 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104758.1-201ENST00000563867 380 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01974-201ENST00000575126 494 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CEACAM8-202ENST00000599005 544 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010615.4-201ENST00000600810 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011458.2-201ENST00000603937 207 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms