Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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CALCOCO2Q13137 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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CALCOCO2Q13137 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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CALCOCO2Q13137 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CALCOCO2Q13137 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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