Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AC013452.1-201ENST00000560630 598 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 UNC5D-205ENST00000449677 2448 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 TTC39C-203ENST00000540918 4117 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 EXOC6-204ENST00000443748 3310 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 MTMR3-205ENST00000406629 3758 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 C11orf44-201ENST00000317019 3547 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 SLC24A1-203ENST00000399033 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 MYRFL-203ENST00000547771 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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HOXD11P31277 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AL513302.1-201ENST00000415679 428 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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HOXD11P31277 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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HOXD11P31277 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AC132825.4-201ENST00000582527 3644 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
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HOXD11P31277 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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HOXD11P31277 LRTOMT-203ENST00000324866 2402 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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HOXD11P31277 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 MAPK10-252ENST00000640970 2620 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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HOXD11P31277 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 MIR595-201ENST00000384905 96 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AC092634.4-203ENST00000451395 448 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AC060766.2-201ENST00000588235 334 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 MIAT_exon5_1.1-201ENST00000618919 149 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 MTHFD1-202ENST00000545908 6814 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
HOXD11P31277 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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