Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SP140Q13342 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SP140Q13342 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SP140Q13342 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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