Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ARL2-SNX15V9GYD0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms