Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CAPN6Q9Y6Q1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAPN6Q9Y6Q1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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