Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms