Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SH3BP1Q9Y3L3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms