Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRELID3BQ9Y3B1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRELID3BQ9Y3B1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms