Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNNQ9UQP3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNNQ9UQP3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms