Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAK1Q9UPV9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAK1Q9UPV9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms