Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TTF2Q9UNY4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms