Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATPIF1Q9UII2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms